研究院实行理事会和院务会制度，下设办公室及11个研究中心，包括烟台价格指数研究中心、山东半岛经济社会研究中心、社情民意调查研究中心、社会稳定风险评估研究中心、社会诚信建设研究中心、地方立法与政府法治研究中心、社会保障研究服务中心、“一带一路”研究中心、公共管理创新与仿真实验室、公司治理与企业发展研究中心、企业理财咨询服务中心。